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大鼠脑组织 Sirt1 转录本定量(cDNA qPCR)

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分别扩增 Sirt1 与 GAPDH,以 GAPDH 为内参,比较大鼠脑组织来源 cDNA 中的 Sirt1 相对表达量。

适用范围与方法

样本:大鼠脑组织 RNA 经反转录获得的 cDNA;每孔 10 ng cDNA。

实时定量 PCR(qPCR)

试剂与材料 BOM

步骤品名角色用量必需 / 可选可替代条件SKU / 规格文献产品
加入 cDNALightCycler 480 384孔反应板(Roche 4729749001)用于LightCycler 480上的Sirt1与GAPDH qPCR反应。

来源指定Roche Diagnostics 4729749001、384孔;这是一手来源中的材料参考,不是本公司可售SKU或供货承诺。

来源未报告必需来源未报告可询价来源未报告
配制反应预混液PowerUp SYBR Green Master Mix(A25776)SYBR Green 扩增预混液

PowerUp SYBR Green Master Mix(A25776)。

5 µL/反应孔必需来源未报告可询价来源未报告
配制反应预混液大鼠 Sirt1 qPCR 正反向引物对Sirt1 目标基因引物

使用所列大鼠 Sirt1 正反向引物序列;与 GAPDH 反应分开。

Sirt1 反应孔加入 1 µL 正反向引物工作混合液(5 µM)必需来源未报告可询价来源未报告
配制反应预混液大鼠 GAPDH qPCR 正反向引物对GAPDH 内参引物

使用所列大鼠 GAPDH 正反向引物序列;与 Sirt1 反应分开。

GAPDH 反应孔加入 1 µL 正反向引物工作混合液(5 µM)必需来源未报告可询价来源未报告
配制反应预混液无核酸酶水(Nuclease-free water)引物稀释用水

无核酸酶水,适用于 qPCR。

用于配制 5 µM 引物工作混合液;加水量由引物储备液浓度确定必需来源未报告可询价来源未报告
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方案 #185 · 修订 3 LightCycler 480 384孔反应板(Roche 4729749001) | 来源未报告 | 可询价 PowerUp SYBR Green Master Mix(A25776) | 5 µL/反应孔 | 可询价 大鼠 Sirt1 qPCR 正反向引物对 | Sirt1 反应孔加入 1 µL 正反向引物工作混合液(5 µM) | 可询价 大鼠 GAPDH qPCR 正反向引物对 | GAPDH 反应孔加入 1 µL 正反向引物工作混合液(5 µM) | 可询价 无核酸酶水(Nuclease-free water) | 用于配制 5 µM 引物工作混合液;加水量由引物储备液浓度确定 | 可询价

实验流程

  1. SYBR Green 反应

    SYBR Green qPCR。

  2. 配制反应预混液

    每孔配制 5ul PowerUp SYBR Green Master Mix(A25776,Applied Biosystems–Thermo Fisher)和 1ul 正反向引物工作混合液(用无核酸酶水配至 5 µM)。

  3. 分装预混液

    使用 Multipette E3 自动移液器,将 6ul SYBR 预混液加入每孔。

  4. 加入 cDNA

    每孔加入 4ul cDNA(10 ng),置于 LightCycler 480 的 384 孔反应板(Roche,4729749001);每项检测设置 3 个技术重复。

  5. 实时扩增

    使用 LightCycler 480:50˚C 2 min;95˚C 2 min;随后 95˚C 15 s、60˚C 1 min,重复 40 个循环。

  6. 读取 Ct

    使用 LightCycler 软件获取各样品的阈值循环数(Ct)。

  7. 表达量分析

    使用内参基因和对照实验组,以 ΔΔCt 法分析表达数据。

质量控制与输出

核对 Sirt1 和 GAPDH 引物序列,分别检查扩增特异性、技术重复一致性及阴性对照。比较组使用一致的样品处理与分析方式;技术重复不计为独立动物数。GAPDH 用作内参前应确认在研究条件下表达稳定。

Sirt1 与 GAPDH 的 Ct 值、ΔCt、相对于对照组的 ΔΔCt,以及 Sirt1 相对表达量(2^−ΔΔCt)。

研究设计
Sirt1 与 GAPDH 分别设置反应,每个样品的每项检测设 3 个技术重复;比较实验组与对照组的归一化表达量。

参考文献

  1. Vila M. Gene expression analysis by quantitative Real-Time PCR (qPCR). protocols.io, v1, 2022. DOI:10.17504/protocols.io.ewov1oyz2lr2/v1. · DOI: 10.17504/protocols.io.ewov1oyz2lr2/v1
  2. Schisandrin ameliorates cognitive deficits, endoplasmic reticulum stress and neuroinflammation in streptozotocin (STZ)-induced Alzheimer’s disease rats. Experimental Animals. PMID:32336744. DOI:10.1538/expanim.19-0146. · DOI: 10.1538/expanim.19-0146
  3. Bustin SA, et al. MIQE précis: Practical implementation of minimum standard guidelines for quantitative real-time PCR experiments. BMC Molecular Biology 2010;11:74. PMID 20858237. doi:10.1186/1471-2199-11-74 · DOI: 10.1186/1471-2199-11-74

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