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大鼠脑组织 Sirt1 转录本定量(cDNA qPCR)

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Quantify Sirt1 relative to GAPDH in cDNA prepared from rat brain RNA using separate SYBR Green qPCR reactions.

Scope and method

Sample:大鼠脑组织 RNA 经反转录获得的 cDNA;每孔 10 ng cDNA。

实时定量 PCR(qPCR)

Reagents and materials

Procedure

  1. SYBR Green 反应

    SYBR Green qPCR。

  2. 配制反应预混液

    每孔配制 5ul PowerUp SYBR Green Master Mix(A25776,Applied Biosystems–Thermo Fisher)和 1ul 正反向引物工作混合液(用无核酸酶水配至 5 µM)。

  3. 分装预混液

    使用 Multipette E3 自动移液器,将 6ul SYBR 预混液加入每孔。

  4. 加入 cDNA

    每孔加入 4ul cDNA(10 ng),置于 LightCycler 480 的 384 孔反应板(Roche,4729749001);每项检测设置 3 个技术重复。

  5. 实时扩增

    使用 LightCycler 480:50˚C 2 min;95˚C 2 min;随后 95˚C 15 s、60˚C 1 min,重复 40 个循环。

  6. 读取 Ct

    使用 LightCycler 软件获取各样品的阈值循环数(Ct)。

  7. 表达量分析

    使用内参基因和对照实验组,以 ΔΔCt 法分析表达数据。

Quality control and readouts

核对 Sirt1 和 GAPDH 引物序列,分别检查扩增特异性、技术重复一致性及阴性对照。比较组使用一致的样品处理与分析方式;技术重复不计为独立动物数。GAPDH 用作内参前应确认在研究条件下表达稳定。

Sirt1 与 GAPDH 的 Ct 值、ΔCt、相对于对照组的 ΔΔCt,以及 Sirt1 相对表达量(2^−ΔΔCt)。

Study design
Sirt1 与 GAPDH 分别设置反应,每个样品的每项检测设 3 个技术重复;比较实验组与对照组的归一化表达量。

References

  1. Vila M. Gene expression analysis by quantitative Real-Time PCR (qPCR). protocols.io, v1, 2022. DOI:10.17504/protocols.io.ewov1oyz2lr2/v1.
  2. Schisandrin ameliorates cognitive deficits, endoplasmic reticulum stress and neuroinflammation in streptozotocin (STZ)-induced Alzheimer’s disease rats. Experimental Animals. PMID:32336744. DOI:10.1538/expanim.19-0146.
  3. Bustin SA, et al. MIQE précis: Practical implementation of minimum standard guidelines for quantitative real-time PCR experiments. BMC Molecular Biology 2010;11:74. PMID 20858237. doi:10.1186/1471-2199-11-74

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