脑组织 RNA 第一链 cDNA 合成
浏览实验方案以纯化的脑组织总 RNA 为模板,使用 ProtoScript II 反转录酶合成第一链 cDNA,供后续基因表达检测。
适用范围与方法
样本:纯化脑组织总 RNA。
- Wistar ICV-STZ rat
- 年龄
- 3–4月龄
- 性别
- 雄性
- 组织
- 脑组织来源总 RNA
试剂与材料 BOM
| 步骤 | 品名 | 角色 | 用量 | 必需 / 可选 | 可替代条件 | SKU / 规格 | 文献产品 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 配制 RNA 与引物混合液 | 无菌微量离心管(cDNA合成用) | 配制脑组织RNA、引物与dNTP混合液,进入第一链cDNA合成流程。 原来源明确无菌微量离心管;未报告管容积或每次实验总量。 | 来源未报告 | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
| 配制反转录体系 | ProtoScript II Reverse Transcriptase(M0368S) | 第一链 cDNA 合成 ProtoScript II Reverse Transcriptase,M0368S,200 U/µl。 | 1 µl/20 µl 反应 | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
| 配制反转录体系 | 5X ProtoScript II RT Reaction Buffer | 反转录缓冲体系 5X ProtoScript II RT Reaction Buffer。 | 4 µl/20 µl 反应 | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
| 配制反转录体系 | Murine RNase Inhibitor(M0314S) | RNase 抑制 Murine RNase Inhibitor,M0314S,40 U/µl。 | 1 µl/20 µl 反应 | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
| 配制反转录体系 | 0.1 M DTT 反转录工作液 | 反转录还原组分 0.1 M DTT 工作液。 | 2 µl/20 µl 反应 | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
| 配制 RNA 与引物混合液 | dNTP 混合液(N0447S) | cDNA 合成底物 dNTP 混合液,N0447S;10 mM 工作液。 | 1 µl/20 µl 反应 | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
| 配制 RNA 与引物混合液 | 反转录随机引物混合液(60 µM) | 反转录引物 60 µM Random Primer Mix;采用随机引物时保留 25 °C 退火步骤。 | 2 µl/20 µl 反应 | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
| 配制 RNA 与引物混合液 | 无核酸酶水(Nuclease-free water) | 反应补水 无核酸酶水。 | RNA、引物与 dNTP 加入后补足至 12 µl | 必需 | 来源未报告 | 可询价 | 来源未报告 |
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实验流程
配制 RNA 与引物混合液
在无菌离心管中加入 RNA:总 RNA 1ng-1 µg 或 poly(A) RNA 1-100 ng;引物 2 µl(50 µM dT 或 60 µM Random Primer Mix);10 mM dNTP 混合液 1 µl。用无核酸酶水补至 12 µl。
RNA 变性
可将混合液置 65 °C - 70 °C 加热 3-5 minutes,短暂离心后立即置冰上。
配制反转录体系
加入 4 µl 5X ProtoScript II RT Reaction buffer、2 µl 0.1 M DTT、1 µl Murine RNase inhibitor(40 U/µl)和 1 µl ProtoScript II Reverse Transcriptase(200 U/µl),总体积 20 µl。
随机引物退火
使用 Random Primer Mix 时,在 42 °C 反应前,先于 25 °C 孵育 00:05:00。
反转录
42 °C 孵育 30 minutes-1 hour。
酶失活
80 °C 孵育 00:05:00。
保存 cDNA
产物置 -20 °C 保存,或进入后续检测。
质量控制与输出
使用完整且无 RNase 污染的 RNA;记录各样品输入量并检查无反转录对照。后续定量采用一致的 cDNA 输入量。
第一链 cDNA,用于后续目标序列扩增。
参考文献
- New England Biolabs. First Strand cDNA Synthesis Kit using ProtoScript II Reverse Transcriptase (M0368), protocols.io v2, 2022-04-11. · DOI: 10.17504/protocols.io.x14egnmmv5dy/v2
- Schisandrin ameliorates cognitive deficits, endoplasmic reticulum stress and neuroinflammation in streptozotocin (STZ)-induced Alzheimer’s disease rats. PMID:32336744. · DOI: 10.1538/expanim.19-0146