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脑组织 RNA 第一链 cDNA 合成

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以纯化的脑组织总 RNA 为模板,使用 ProtoScript II 反转录酶合成第一链 cDNA,供后续基因表达检测。

适用范围与方法

样本:纯化脑组织总 RNA。

反转录与 cDNA 合成

试剂与材料 BOM

步骤品名角色用量必需 / 可选可替代条件SKU / 规格文献产品
配制 RNA 与引物混合液无菌微量离心管(cDNA合成用)配制脑组织RNA、引物与dNTP混合液,进入第一链cDNA合成流程。

原来源明确无菌微量离心管;未报告管容积或每次实验总量。

来源未报告必需来源未报告可询价来源未报告
配制反转录体系ProtoScript II Reverse Transcriptase(M0368S)第一链 cDNA 合成

ProtoScript II Reverse Transcriptase,M0368S,200 U/µl。

1 µl/20 µl 反应必需来源未报告可询价来源未报告
配制反转录体系5X ProtoScript II RT Reaction Buffer反转录缓冲体系

5X ProtoScript II RT Reaction Buffer。

4 µl/20 µl 反应必需来源未报告可询价来源未报告
配制反转录体系Murine RNase Inhibitor(M0314S)RNase 抑制

Murine RNase Inhibitor,M0314S,40 U/µl。

1 µl/20 µl 反应必需来源未报告可询价来源未报告
配制反转录体系0.1 M DTT 反转录工作液反转录还原组分

0.1 M DTT 工作液。

2 µl/20 µl 反应必需来源未报告可询价来源未报告
配制 RNA 与引物混合液dNTP 混合液(N0447S)cDNA 合成底物

dNTP 混合液,N0447S;10 mM 工作液。

1 µl/20 µl 反应必需来源未报告可询价来源未报告
配制 RNA 与引物混合液反转录随机引物混合液(60 µM)反转录引物

60 µM Random Primer Mix;采用随机引物时保留 25 °C 退火步骤。

2 µl/20 µl 反应必需来源未报告可询价来源未报告
配制 RNA 与引物混合液无核酸酶水(Nuclease-free water)反应补水

无核酸酶水。

RNA、引物与 dNTP 加入后补足至 12 µl必需来源未报告可询价来源未报告
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方案 #187 · 修订 3 无菌微量离心管(cDNA合成用) | 来源未报告 | 可询价 ProtoScript II Reverse Transcriptase(M0368S) | 1 µl/20 µl 反应 | 可询价 5X ProtoScript II RT Reaction Buffer | 4 µl/20 µl 反应 | 可询价 Murine RNase Inhibitor(M0314S) | 1 µl/20 µl 反应 | 可询价 0.1 M DTT 反转录工作液 | 2 µl/20 µl 反应 | 可询价 dNTP 混合液(N0447S) | 1 µl/20 µl 反应 | 可询价 反转录随机引物混合液(60 µM) | 2 µl/20 µl 反应 | 可询价 无核酸酶水(Nuclease-free water) | RNA、引物与 dNTP 加入后补足至 12 µl | 可询价

实验流程

  1. 配制 RNA 与引物混合液

    在无菌离心管中加入 RNA:总 RNA 1ng-1 µg 或 poly(A) RNA 1-100 ng;引物 2 µl(50 µM dT 或 60 µM Random Primer Mix);10 mM dNTP 混合液 1 µl。用无核酸酶水补至 12 µl。

  2. RNA 变性

    可将混合液置 65 °C - 70 °C 加热 3-5 minutes,短暂离心后立即置冰上。

  3. 配制反转录体系

    加入 4 µl 5X ProtoScript II RT Reaction buffer、2 µl 0.1 M DTT、1 µl Murine RNase inhibitor(40 U/µl)和 1 µl ProtoScript II Reverse Transcriptase(200 U/µl),总体积 20 µl。

  4. 随机引物退火

    使用 Random Primer Mix 时,在 42 °C 反应前,先于 25 °C 孵育 00:05:00。

  5. 反转录

    42 °C 孵育 30 minutes-1 hour。

  6. 酶失活

    80 °C 孵育 00:05:00。

  7. 保存 cDNA

    产物置 -20 °C 保存,或进入后续检测。

质量控制与输出

使用完整且无 RNase 污染的 RNA;记录各样品输入量并检查无反转录对照。后续定量采用一致的 cDNA 输入量。

第一链 cDNA,用于后续目标序列扩增。

参考文献

  1. New England Biolabs. First Strand cDNA Synthesis Kit using ProtoScript II Reverse Transcriptase (M0368), protocols.io v2, 2022-04-11. · DOI: 10.17504/protocols.io.x14egnmmv5dy/v2
  2. Schisandrin ameliorates cognitive deficits, endoplasmic reticulum stress and neuroinflammation in streptozotocin (STZ)-induced Alzheimer’s disease rats. PMID:32336744. · DOI: 10.1538/expanim.19-0146

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